Windenergie, net als elke vorm van energieproductie, heeft enkele nadelen. De elektriciteitsproductie is niet constant en afhankelijk van de windsnelheid. Windmolens zijn zichtbaar in het landschap en kunnen geluid en slagschaduw veroorzaken. Ze kunnen ook impact hebben op vogels en vleermuizen. Dit wordt grondig onderzocht. Hoe beter de plaats waar hij ingeplant is, hoe minder nadelige effecten.